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一般健康人群無需常用漱口水，只要早晚刷牙，配合使用牙線清潔已足夠 。尤其是藥物性漱口水更有慎用。藥物性漱口水有輔助治療作用，一般用在牙齦炎和牙周手術后，不能作為日常口腔護理藥品長期使用。當口腔疾病痊愈后，就應停止使用，以免引起口腔內正常菌群失調和產生抗藥性。

市面出售的漱口水有多種配方，如百里酚、三氯生、葡萄糖酸氯己定等。其中葡萄糖酸氯己定證實有效抑制牙菌膜滋長，防止牙周病，但同時發現若長期使用，會令牙漬沉積于牙齒表面，以及影響味覺。一般含有葡萄糖酸氯己定配方的漱口水，配給牙周病患者、口腔潰瘍或做完口腔手術的人，但不應長期使用，避免令牙漬沉積。